问题分析：一般来说，先天性甲状腺功能低下症的原因有孕妇孕期饮食缺碘、宝宝甲状腺发育不全、母亲服用了抗甲状腺的药物、母亲本身有自身免疫性疾病。具体分析如下：
1、先天性甲状腺功能低下症的原因有孕妇孕期饮食缺碘，进而可能会导致胎儿在胚胎期就因为碘缺乏。
2、先天性甲状腺功能低下症的原因有宝宝甲状腺发育不全，进而可能会导致胎儿在胚胎期就因为碘缺乏。
3、先天性甲状腺功能低下症的原因有母亲服用了抗甲状腺的药物；进而可能会导致胎儿在胚胎期就因为碘缺乏。
4、先天性甲状腺功能低下症的原因有母亲本身有自身免疫性疾病，影响了宝宝的甲状腺功能。进而可能会导致胎儿在胚胎期就因为碘缺乏。
