问题分析:自身免疫性脑炎可能会有难治性的癫痫、遗留智能障碍等后遗症。1、难治性的癫痫,这种情况比较常见,有可能是自身免疫性脑炎导致的难治性癫痫。2、遗留智力缺陷,如运动发育迟缓、语言发育迟缓等,还有一些病人会表现为偏瘫、失语等局部的神经功能缺损。免疫功能低下或有免疫缺陷疾病的患者,如果出现头痛、头晕、脑电图异常等症状,要做好免疫学、脑脊液等检查,明确原因后进行治疗。